档案年龄比实际年龄小两岁，可通过合法途径申请更正。
分析：根据《中华人民共和国档案法》及相关规定，当发现档案中的年龄与实际年龄不符时，应首先核实身份证、户口本、出生证明等法定证件以确认实际年龄。随后，向档案管理部门提交更正申请，并提供相关证明材料。档案管理部门将审核申请，如核实无误，将更正档案年龄。若问题严重到影响退休等权益，或档案管理部门拒绝更正且理由不充分时，应及时咨询法律专业人士。
提醒：若因档案年龄问题导致退休手续长期无法办理，影响生活，应及时寻求专业人士的进一步帮助。
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从法律角度，针对档案年龄比实际年龄小两岁的问题，不同情况下的处理方式如下：
1. 若实际年龄是后期登记时填写错误导致，可持身份证、户口本、出生证明等相关证据到户籍管理部门或档案管理部门申请更正年龄。
2. 在提交更正申请时，需按照档案管理部门的要求填写申请表格，并附上所有相关证据。清晰陈述年龄不符的情况及请求更正的原因。
3. 提交申请后，需耐心等待档案管理部门的审核。若需补充材料或进行进一步调查，应积极配合。
4. 若档案管理部门拒绝更正申请且理由不充分，可以考虑通过法律途径解决争议，如申请行政复议或提起诉讼。在此之前，应充分了解相关法律法规和程序。
在整个过程中，建议保持冷静和耐心，遵循法律程序进行。同时，注意保护个人隐私和信息安全。