计算每日万分之五的违约金，需先确定合同金额。依据《中华人民共和国民法典》，若合同未具体约定，则按一般原则执行。未及时计算可能导致权益受损，影响合同执行。
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计算违约金分三步。首先，明确合同金额；其次，根据合同或《民法典》确定违约金比例；最后，按日计算。若合同不明，需协商或依法裁定。
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处理违约金计算问题，常见方式有协商、诉讼或仲裁。选择时需考虑效率、成本及合同约定，协商不成再考虑法律途径，依据《民法典》维护权益。