农用三轮车丢失，可申请注销登记。需向车管所提交相关证明。分析：根据《机动车登记规定》，机动车灭失的，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请注销登记，并交回机动车登记证书、号牌和行驶证。若车辆无法交回，则需提交机动车灭失的书面声明。提醒：若长时间未办理注销登记，可能导致无法办理其他车辆登记业务，或产生不必要的法律责任。出现此类情况时，应及时咨询车管所并办理注销。
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具体操作：1.若农用三轮车丢失，首先应向当地公安机关报案，并取得报案证明。2.准备机动车登记证书、号牌、行驶证以及机动车灭失的书面声明。3.前往当地车管所提交上述材料，并填写《机动车注销登记申请表》。4.车管所审核通过后，将注销该农用三轮车的户口，并收回相关证件。5.若车辆无法交回（如已完全损坏），需在书面声明中注明原因，并承诺承担相应法律责任。6.完成注销登记后，应妥善保管好注销证明，以备后续需要。
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处理方式：从法律角度，处理农用三轮车注销户口的常见方式有两种：一是向当地车管所提交书面申请，并提供相关证明材料；二是若车辆已完全损坏或无法找回，需提交机动车灭失的书面声明。选择方式：若车辆确实丢失且无法找回，建议选择提交机动车灭失的书面声明方式办理注销登记；若车辆还能找回或存在争议，则应先解决争议后再申请注销。