综合工时制年假按工时算。依据《职工带薪年休假条例》，职工连续工作1年以上享带薪年休假，单位应保证，期间工资照发。不及时安排年假，可能影响员工权益，造成劳动纠纷。
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综合工时制年假常见处理为按工时计算。选择时，需确保符合法律法规，考虑员工实际工时及单位安排，确保年假合理合法且不影响工作运营。
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综合工时制年假按工时。具体操作：1.确认员工连续工作1年以上；2.根据工时记录计算年假时长；3.与员工协商确定休假时间；4.年假期间工资照发；5.确保年假安排不影响工作进度。